Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D8

C6, Complement component 6, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6E9Q6D8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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C6E9Q6D8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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C6E9Q6D8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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C6E9Q6D8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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C6E9Q6D8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C6E9Q6D8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6E9Q6D8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6E9Q6D8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6E9Q6D8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6E9Q6D8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C6E9Q6D8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C6E9Q6D8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6E9Q6D8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C6E9Q6D8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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C6E9Q6D8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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C6E9Q6D8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C6E9Q6D8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C6E9Q6D8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6E9Q6D8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6E9Q6D8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms