Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms