Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5D8

Vmn2r48, Vomeronasal 2, receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r48E9Q5D8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r48E9Q5D8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r48E9Q5D8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r48E9Q5D8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r48E9Q5D8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r48E9Q5D8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r48E9Q5D8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r48E9Q5D8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r48E9Q5D8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r48E9Q5D8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r48E9Q5D8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r48E9Q5D8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r48E9Q5D8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn2r48E9Q5D8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn2r48E9Q5D8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn2r48E9Q5D8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn2r48E9Q5D8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn2r48E9Q5D8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn2r48E9Q5D8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms