Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm20518E9Q548 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
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