Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Pdzd2E9Q1M1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Pdzd2E9Q1M1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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Pdzd2E9Q1M1 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Pdzd2E9Q1M1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Pdzd2E9Q1M1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Pdzd2E9Q1M1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms