Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Zfp558E9Q1J0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms