Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
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Ddx60E9PZQ1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Ddx60E9PZQ1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
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Ddx60E9PZQ1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx60E9PZQ1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Ddx60E9PZQ1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Ddx60E9PZQ1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Ddx60E9PZQ1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Ddx60E9PZQ1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Ddx60E9PZQ1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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