Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms