Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms