Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3bE9PUL3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clca3bE9PUL3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms