Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Soga1E1U8D0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Soga1E1U8D0 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms