Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cngb1E1AZ71 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cngb1E1AZ71 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cngb1E1AZ71 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cngb1E1AZ71 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cngb1E1AZ71 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cngb1E1AZ71 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cngb1E1AZ71 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cngb1E1AZ71 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cngb1E1AZ71 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cngb1E1AZ71 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cngb1E1AZ71 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cngb1E1AZ71 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cngb1E1AZ71 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cngb1E1AZ71 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cngb1E1AZ71 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cngb1E1AZ71 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cngb1E1AZ71 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cngb1E1AZ71 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cngb1E1AZ71 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cngb1E1AZ71 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cngb1E1AZ71 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cngb1E1AZ71 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cngb1E1AZ71 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cngb1E1AZ71 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cngb1E1AZ71 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cngb1E1AZ71 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms