Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms