Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms