Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms