Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3543D3Z235 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3543D3Z235 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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