Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rnf217D3YYI7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rnf217D3YYI7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rnf217D3YYI7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rnf217D3YYI7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rnf217D3YYI7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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