Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms