Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cttnbp2B9EJA2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms