Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms