Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud7bB2RUR8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms