Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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