Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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