Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms