Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rrn3B2RS91 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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