Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms