Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H60cB1B213 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H60cB1B213 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H60cB1B213 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H60cB1B213 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms