Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a6B1AVK5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a6B1AVK5 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a6B1AVK5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a6B1AVK5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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