Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn8B1ARD8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms