Protein–RNA interactions for Protein: A7XV04

Skint7, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint7A7XV04 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Skint7A7XV04 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms