Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Skint5A7XUY5 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skint5A7XUY5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skint5A7XUY5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skint5A7XUY5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skint5A7XUY5 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Skint5A7XUY5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skint5A7XUY5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skint5A7XUY5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skint5A7XUY5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skint5A7XUY5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skint5A7XUY5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Skint5A7XUY5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Skint5A7XUY5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Skint5A7XUY5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Skint5A7XUY5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Skint5A7XUY5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Skint5A7XUY5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Skint5A7XUY5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Skint5A7XUY5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Skint5A7XUY5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Skint5A7XUY5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Skint5A7XUY5 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Skint5A7XUY5 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Skint5A7XUY5 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Skint5A7XUY5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skint5A7XUY5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms