Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms