Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5640A3KG49 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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