Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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