Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttll9A2APC3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttll9A2APC3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttll9A2APC3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttll9A2APC3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttll9A2APC3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttll9A2APC3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttll9A2APC3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttll9A2APC3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttll9A2APC3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttll9A2APC3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttll9A2APC3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttll9A2APC3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttll9A2APC3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms