Protein–RNA interactions for Protein: A2APA5

Fam209, 1700029J11Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam209A2APA5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam209A2APA5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam209A2APA5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam209A2APA5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam209A2APA5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam209A2APA5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam209A2APA5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam209A2APA5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam209A2APA5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam209A2APA5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam209A2APA5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam209A2APA5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam209A2APA5 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam209A2APA5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam209A2APA5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam209A2APA5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam209A2APA5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam209A2APA5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam209A2APA5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam209A2APA5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam209A2APA5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam209A2APA5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam209A2APA5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam209A2APA5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam209A2APA5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam209A2APA5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam209A2APA5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam209A2APA5 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam209A2APA5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms