Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SetxA2AKX3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms