Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms