Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms