Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms