Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Myom3A2ABU4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myom3A2ABU4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms