Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms