Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Trav12-2A0N8N6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Trav12-2A0N8N6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trav12-2A0N8N6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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