Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ccdc194A0A140LIT1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ccdc194A0A140LIT1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ccdc194A0A140LIT1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ccdc194A0A140LIT1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ccdc194A0A140LIT1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ccdc194A0A140LIT1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Ccdc194A0A140LIT1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Ccdc194A0A140LIT1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc194A0A140LIT1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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