Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JEU3

Trdc, T cell receptor delta, constant region (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdcA0A0G2JEU3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TrdcA0A0G2JEU3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TrdcA0A0G2JEU3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms