Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm45715-201ENSMUST00000206991 434 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 1700039M10Rik-201ENSMUST00000180397 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm3238W4VSP7 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm3238W4VSP7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm3238W4VSP7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Mterf1b-201ENSMUST00000177258 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm3238W4VSP7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 C030010L15Rik-201ENSMUST00000181465 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm43952-201ENSMUST00000203765 751 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms