Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms