Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms