Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Robo3Q9Z2I4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Robo3Q9Z2I4 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Robo3Q9Z2I4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Robo3Q9Z2I4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Robo3Q9Z2I4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Robo3Q9Z2I4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Robo3Q9Z2I4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Robo3Q9Z2I4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Robo3Q9Z2I4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms