Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms